Yaquien kristautzea izan zen 1609an erlijiosoak hedatzea ahalbidetu zuena, Sonorako lurraldean barneratuz.
Kolonian zehar, Sonora entitate horren mugetan sartutako Sierra Madre Occidentaleko maldekin bakarrik zetorren. Yaqui ibaitik iparraldera zihoan eskualdeari, Real de la Cieneguilla barne, Pimería Baja deitzen zitzaion eta iparraldeko eskualdeari, Real horretatik Colorado ibairaino - dagoeneko Arizonako Ipar Amerikako estatuan dagoeneko - Pimería Alta.
Egungo Sonorako lurraldeak eskualde txiki bat ere biltzen du, orduan Pimería izenarekin ezagutzen zenaren hego-mendebaldean, Chihuahua eta Ostimuri estatuan kokatua, Kaliforniako Golkoko kostaldeetan kokatutako lekua, Mayo eta Yaqui ibaien artean.
1614an Perez de Rivas eta Pedro Méndez misiolariek maiak kristautzen zituzten Ostimuri eremuan, misioa hiru Barrutitan banatuz: Santa Cruz (Mayo bokalean), Navojoa eta Tesia.
Tepahue-ak Kornikariekin batera sartu ziren 1620an. Aita Miguel Godínez-ek San Andres de Cornicari eta Asunción de Tepahui-ren misioak sortu zituen. . Urte horretan bertan San Inazioko errektoretza sortu zen, eta lehen aipatutako bost misioez gain, Yaquiren bokalean kokatutako Bacúm, Torín eta Rahún-ekoak biltzen zituen.
1617an yakiak Pérez de Rivas eta Tomás Basilio gurasoek bihurtu zituzten. Matxinadak, istiluak, oinazeak eta hilketak jasan arren, Sonoraren bihurketa azkarragoa eta sendotuagoa izan zen. XVII. Mendera arte jesuitek Maycoba eta Yecora-ren misioa sortu zuten Chínipas izenarekin ezagutzen zuten hego-mendebaldean.
Yaqui ibaitik iparralderako misioak lau erretoreetan banatu ziren: San Borjak Cucumaripa eta Tecoripa-ren misioak biltzen zituen. , 1619an sortua; Movas eta Onovas, 1622an; Sahuaripa 1627an; Matape 1629an; Onapa 1677an eta Arivechi , 1727an. Japoniako Hiru Martiri Santuen Errektoretza: Batuco 1627an sortua, Oposura 1640an eta Bacadeguachi , Guazavak , Santa María Baceraca eta San Miguel Bavispe , 1645. urtean sortu zen. Eta 1636an Uresen misioak integratu zituen San Javierreko Errektoretza; Aconchi, Opodepe eta Banámichi 1639an; Cucurpe eta Arizpe 1648an, eta Cuaquiárachi 1655ean.
1687an, Eusebio Francisco Kino misiolaria Pimería Alta-ra sartu zen eta Doloreseko Andre Mariaren Errektoretzaren misioak hasi zituen: Caborca, Francisco Javier Saeta bere laguntza espiritualarekin korrespondentzia mantentzen zuen. Kino; Atil, Tubutama, Andre Maria Sorrows de Saric, Pitiquito, Aiil, Oquitoa, Magdalena, San Ignacio, Cocóspera eta Imuris.
Jesuitak kanporatu ondoren, misioak frantziskotarren ardurapean zeuden, ez baitzuten gehiago eraiki eta lehendik zeudenak gordetzen saiatzera soilik mugatu ziren. Jesuitek dagoeneko Sinaloan eta Sonoran kokatu zituzten asentamenduak, Kaliforniako lurraldera begiratu zuten.
